Inovativní metody zpracování bakterií, které nebyly dříve kultivovány. Uznání: Molina-Manor, Gimno-Valero, Perto and Forker
Studie závislá na kultuře umožnila izolovat velké a překvapivé množství různých bakteriálních kmenů a dosud nebyly hlášeny z pouště v hospodě.
Mikroorganismy jsou nejhojnější a nejrozmanitější formou života na Zemi. Drtivá většina z nich však zůstává neznámá. Ve skutečnosti pouze malá část mikroorganismů naší planety může být kultivována za tradičních podmínek, takže z naší říše zůstane svět nepěstovatelných organismů. To platí zejména pro bakterie, kterým se daří v extrémních podmínkách, protože drsné podmínky je téměř nemožné v laboratoři obnovit. I když bylo na saharské, atakamské a gibsonské poušti provedeno několik mikrobiálních studií, evropské suché půdy zůstaly špatně studovány.
Abychom konečně prozkoumali mikrobiální komunitu některých evropských pouští, vědci z University of Valencia a Darwinova excelence v biologickém průzkumu, zde jsme zkoumali bakteriální rozmanitost polosuché pouště Taverns. Za tímto účelem tým vyvinul nové přístupy k bakteriální kultuře.
Polosuchá poušť Taverns v provincii Almeria ve Španělsku. Uznání: Molina-Manor, Gimno-Valero, Perto and Forker
„Turistické pouštní kultury byly ideálním spojením mezi špatně prozkoumaným prostředím a aplikací jednoduchých, ale výkonných pěstitelských technik, včetně dlouhé inkubační doby, zředěného média a pečlivého sklizně kolonií,“ říká Dr. Manuel Forker, vedoucí univerzity ve Valencii, prezident Darwin Bioprospecting Excellence „A autor nejnovější studie.
Vědci experimentovali s různými kultivačními metodami, aby našli tolerantní podmínky pro nekultivované druhy. Jejich strategií by bylo kombinovat různá média prostřednictvím sériového ředění živin (až stokrát) a prodloužit inkubační dobu (až měsíc). Celkem bylo izolováno 254 kmenů bakterií. Většina druhů izolovaných z koncentrovaného média byla dříve popsána jako obyvatelé půdy nebo druhy izolované z jiných pouští. 60% druhů izolovaných z vysoce zředěného média však není druhem neidentifikovaných bakterií. Kromě toho hraní během inkubačních časů také umožnilo po měsíci izolovat některé oligotropní kmeny (bakterie, které rostou pomalu a žijí za nízkých nutričních podmínek), které by jinak bylo obtížné pěstovat v laboratorních podmínkách.
Polosuchá poušť Taverns v provincii Almeria ve Španělsku. Uznání: Molina-Manor, Gimno-Valero, Perto and Forker
Celkově tato studie zdůrazňuje potenciál jednoduchých strategií k dosažení vyšší antimikrobiální rozmanitosti než u přírodních vzorků, zejména pokud jsou převzaty z extrémních prostředí. Ale nevyužitá bakteriální biodiverzita pouště v hospodě může mít dopad daleko za hranice ekologie a bakteriologie:
„V současné době charakterizujeme některé z neidentifikovaných bakterií, z nichž tři jsou nové druhy chinokoků. Jsem si jist, že některé bakteriální kmeny produkují biotechnologicky relevantní produkty. Jde pouze o provedení správného screeningu,“ říká Forker.
Odkaz: „High Cultural Bacterial Diversity from the European Desert: The Tavern Desert“, autorky: Esther Molina-Manor, Helena Gimno-Valero, Javier Pascual 2. července, Perto a Manuel Forker, 8. ledna 2021, Meze v mikrobiologii.
DOI: 10,3389 / fmicb.2020.583120