Vědci identifikovali geny spojené s významně zvýšeným rizikem COVID-19

Varianty genetického rizika v genu ABO by mohly významně zvýšit šance na vývoj COVID-19, podle výzkumu prezentovaného na mezinárodní konferenci ATS 2021 mohou také jiné geny zvyšovat riziko COVID-19.

Mnoho informací o přípravku COVID-19 zůstává lékařskou záhadou, včetně toho, zda určité geny vystavují jednotlivce vyššímu riziku infekce SARS-CoV-2 virus, který způsobuje COVID-19. Ana Hernandez Cordero, Ph.D., postdoktorandka z Centra pro inovace srdečních plic na University of British Columbia, a kolegové použili k identifikaci těchto genů integrativní genomiku v kombinaci s proteomikou.

Genomický výzkum identifikuje specifické geny, které mohou hrát roli v biologických procesech, jako je vývoj onemocnění, zatímco proteomie dělá totéž pro proteiny. Výzkumníci mohou získat ucelenější obrázek o procesu nemoci integrací výzkumných nástrojů do obou.

DNA je velká, složitá molekula, takže samotné genetické asociace nemohou určit přesný gen zodpovědný za COVID-19, “řekl Dr. Hernandez. „Avšak kombinací genetické informace COVID-19 s genovou expresí a proteomickými datovými soubory můžeme zjistit, které geny spouští vazbu na COVID-19.“

Vědci spojili genetickou informaci s testem exprese plicního genu, aby identifikovali genetické varianty, které řídí genovou expresi v plicích odpovědných za COVID-19. Vědci identifikovali markery specifických genů, které sdílejí své účinky na genovou expresi a hladiny proteinů s citlivostí na COVID-19. Pro analýzu použili bioinformatiku k integraci: (1) souboru genomických dat získaných od pacientů infikovaných SARS-CoV-2 i od neinfikovaných jedinců (kontroly); (2) soubory údajů o genové expresi plic a krevních tkání z klinických populací (non-COVID-19); a (3) soubor údajů o proteomu získaných od dárců krve (non-COVID-19).

Přitom zjistili, že několik genů odpovědných za reakci imunitního systému na COVID-19 se také podílí na citlivosti na COVID-19. To, co objevili, podporuje zjištění předchozího výzkumu.

Hledáním kandidátských genů v krevních bílkovinách byli schopni jít o krok dále ve spojování účinků genů na citlivost na COVID-19. Krevní proteomy mohou také pomoci identifikovat markery v krvi, které lze snadno měřit, aby indikovaly stav onemocnění a potenciální monitorování nemoci.

„S využitím síly genomové informace jsme identifikovali geny spojené s COVID-19,“ řekl Dr. Hernandez. „Konkrétně jsme zjistili, že gen ABO je významným rizikovým faktorem pro COVID-19. Zvláštní pozornost byla věnována souvislosti mezi krevní skupinou ABO a rizikem COVID-19. Ukázali jsme, že vztah není jen asociací, ale také kauzálním. “

Kromě genu ABO dr. Hernandez a kolegové zjistili, že lidé nesoucí určité genetické varianty pro SLC6A20, ERMP1, FCER1G a CA11 měli významně vyšší riziko infekce COVID-19. „Tito lidé by měli být během pandemie velmi opatrní. Tyto geny se také mohou ukázat jako dobré markery pro onemocnění i jako potenciální lékové cíle. “

Několik genů identifikovaných ve výzkumné analýze již bylo spojeno s respiračními chorobami. Například ERMP1 je spojen s astmatem. CA11 může také zvýšit riziko COVID-19 u lidí s cukrovkou.

Genetické asociace pro COVID-19 a genová a proteinová exprese byly kombinovány pomocí integrativní genomiky (IG). IG si klade za cíl identifikovat mechanismy (například: úrovně genové exprese), které spojují účinky genetického kódu s komplexním onemocněním. Tyto metody, i když jsou složité, jsou také rychlé a jejich výsledky mohou vědcům pomoci upřednostňovat kandidáty na geny pro testy in vitro (laboratorní) a in vivo (živé organismy).

Dr. Hernandez dodal: „Náš výzkum pokročil od doby, kdy jsme tuto analýzu provedli poprvé. Nyní jsme identifikovali ještě zajímavější kandidáty na COVID-19, jako jsou IL10RB, IFNAR2 a OAS1. Tyto geny jsou spojeny s těžkým COVID-19. Jejich role v imunitní odpovědi na virové infekce a rostoucí důkazy naznačují, že tito kandidáti a jejich role v COVID-19 by měli být dále zkoumány. “

Odkaz: „Integrativní genomová analýza zdůrazňuje potenciální genetické rizikové faktory pro Covid-19“ od AI Hernandez Cordero, X. Li1, S. Milne, C. Yang, Y. Bossé, P. Joubert, W. Timens, M. Van den Berge , D. Nickle, K. Hao a DD Sin, 3. května 2021, ATS 2021 International Conference.
souhrn

Related articles

Comments

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here

Share article

Latest articles

Drsná kůra, která se v noci ozývá, vede k objevení nových druhů

V lesích západní a střední Afriky se v noci ozývají hlasitá volání hybridů stromů - malých, býložravých savců, ale jejich zvuk se liší podle...

Nástroj Nový nástroj určený k podpoře vývoje a vývoje automobilových vozidel

Schematický vnitřní provoz elektrod v palivovém článku և kapacita základních parametrů. Půjčka:Heinz a kol., 2021: Široké používání tradičních vozidel na vodíkový pohon nad tradičními...

Identifikace velmi počátečních kroků, které vedou k rozvoji rakoviny

Konfokální mikrofotografie tenkého střeva myši pomocí technologie Red2Onco. S Red2Onco můžete označit onkogenní mutantní klony (červené klony) a běžné nebo divoké klony (žluté...

Neandertálci a raná moderní lidská kultura koexistovali vedle starších tradic již více než 100 000 let

Výzkum Fakulty antropologie a ochrany na University of Kent zjistil, že jedna z prvních kultur kamenných nástrojů známá jako Acheulean trvala pravděpodobně o desítky...

Snadná věda: co jsou sterilní neutrina?

Sterilní neutrina jsou speciální typ neutrin, který byl navržen k vysvětlení některých neočekávaných experimentálních výsledků, ale nakonec nebyl objeven. Vědci je hledají v...

Newsletter

Subscribe to stay updated.